El Plan de Manejo es un instrumento de gestión, que se fundamenta en un proceso de planificación y que comprende aspectos técnicos, normativos y orientadores destinados a garantizar la conservación de un área protegida, a través del ordenamiento del uso de su espacio (Manual Técnico N°23 de CONAF).

Parques Nacionales (por orden alfabético)

Alberto de Agostini (Guía de Manejo)
Alerce Andino
Alerce Costero (Sin Plan de Manejo)
Archipiélago de Juan Fernández
Bernardo O'Higgins (Guía de Manejo)
Bosque de Fray Jorge
Cabo de Hornos (Sin Plan de Manejo)
Conguillío
Corcovado (Sin Plan de Manejo)
Chiloé
Hornopirén
Huerquehue
Isla Guamblin (Sin Plan de Manejo)
Isla Magdalena (Sin Plan de Manejo)
La Campana 
Laguna del Laja
Laguna San Rafael (Guía de Manejo)
Lauca
Llanos de Challe
Llullaillaco
Morro Moreno (Sin Plan de Manejo)
Nahuelbuta
Nevado de Tres Cruces
Pali Aike
Pan de Azúcar
Puyehue
Queulat
Radal Siete Tazas
Rapa Nui
Salar de Huasco (Sin Plan de Manejo)
Tolhuaca
Torres del Paine
Villarrica
Vicente Pérez Rosales
Volcán Isluga

Reservas Nacionales (por orden alfabético)

Alacalufes
Alto Bío-Bío (Sin Plan de Manejo)
Altos de Lircay
Coyhaique
Cerro Castillo (Sin Plan de Manejo)
China Muerta (Sin Plan de Manejo)
El Yali
Federico Albert
Futaleufú (Sin Plan de Manejo)
Isla Mocha
Katalalixar (Sin Plan de Manejo)
La Chimba
Las Guaitecas (Sin Plan de Manejo)
Lago Carlota
Lago Cochrane 
Lago Jeinimeni (Guía de Manejo)
Lago Las Torres (Guía de Manejo)
Lago Palena
Lago Peñuelas
Lago Rosselot (Sin Plan de Manejo)
Laguna Parrillar
Laguna Torca
Las Chinchillas
Las Vicuñas
Los Bellotos del Melado
Los Flamencos
Los Huemules de  Niblinto
Los Queules
Los Ruiles 
Llanquihue (Sin Plan de Manejo)
Magallanes
Malalcahuello
Malleco
Mocho-Choshuenco
Nalcas (Sin Plan de Manejo)
Nonguén (Sin Plan de Manejo)
Ñuble
Pampa del Tamarugal
Pingüino de Humboldt
Ralco
Río Clarillo
Río Simpson 
Río de los Cipreses
Roblería del Cobre de Loncha
Trapananda
Villarrica
 
Monumentos Naturales (por orden alfabético)

Cerro Ñielol
Contulmo
Cinco Hermanas (Sin Plan de Manejo)
Cueva del Milodón
Dos Lagunas (Sin Plan de Manejo)
El Morado
Isla Cachagua
Islotes de Puñihuil
Lahuen Ñadi
Laguna de los Cisnes
Los Pingüinos
La Portada
Pichasca
Quebrada de Cardones (Sin Plan de Manejo)
Salar de Surire